Fernando Llorente nació el 26 de febrero de 1985, en Pamplona, adonde su madre había acudido para dar a luz, desde la localidad riojana de Rincón de Soto, donde residía. En su localidad, Rincón de Soto, La Rioja no había equipo infantil, por lo que comenzó jugando en el equipo navarro C. F. Funes. Un año después pasó a formar parte de las categorías inferiores del Club Atlético River Ebro, el club de su localidad, donde estuvo temporada y media. Copa del Rey. Los goles llegaron en los minutos 32′, 58′ y 65′, con un resultado final de Athletic 6-0 U.D. Fue uno de los líderes del doblete y en el Calderón aún recuerdan sus lanzamientos de falta y su cabezazo que dio el título de Copa en la final ante el Barça. En el 25, Movilla ganó la espalda a la defensa y, en un mano a mano con Luque con todo el tiempo del mundo, amagó para engañar al portero y clavó el segundo en las redes. Habitual en las categorías inferiores de la selección española, ganó la Bota de Plata del Mundial de Fútbol Sub-20 de 2005. Con la selección absoluta debutó frente a la selección chilena el 19 de noviembre de 2008, en El Madrigal.
El 16 de enero de 2005 debutó, con el Athletic Club, en Primera División frente al RCD Espanyol en el Estadio San Mamés. El 16 de enero de 2005, el entrenador del Athletic Club, Ernesto Valverde, camisetas futbol 2022 hizo debutar a Llorente en Primera División durante el partido Athletic Club 1-1 R. C. D. Espanyol en San Mamés. Incluso durante su estancia en el Juvenil, el Arsenal F. C. intentó llevárselo a Londres, pero la elección del nuevo presidente, Fernando Lamikiz, impidió su salida y concilió la situación. Tras la turbulenta salida del equipo catalán, Luis Suárez tenía la oportunidad de hacerle ver a los dirigentes culés que todavía está para competir al primer nivel. En los inicios de la temporada 2007/2008, la salida del veterano delantero Ismael Urzaiz y el fichaje del entrenador andaluz Joaquín Caparrós resultó fundamental, tanto para el Athletic Club como para el jugador. Por tanto, el Atlético no ‘usurpó’ nada pues en un principio se trató del mismo club.
En la temporada 2003/2004, con dieciocho años, fue incorporado al Club Deportivo Basconia, segundo filial del Athletic en Tercera División. El 14 de marzo de 2018 el seleccionador galo Didier Deschamps anunció la convocatoria del central del Atlético de Madrid para dos partidos amistosos ante Colombia y Rusia. El 17 de mayo de 2018, el seleccionador Didier Deschamps lo incluyó en la lista de 23 para el Mundial. Participó en la Copa Mundial de Fútbol de 1974 con la Selección brasileña disputando seis partidos contra Yugoslavia, Escocia, Zaire, Alemania Oriental, Argentina y Holanda. Tres jóvenes jugadores de la cantera, Arteche, Marcos Alonso y Quique Setién, serían fundamentales en el equipo y todos ellos llegarían con el tiempo a jugar en la selección española. 2003 ascendió al segundo equipo filial del club, el Club Deportivo Basconia, que competía en Tercera División. 74 veces ha tirado a portería el Barcelona en las primeras 14 jornadas del torneo por las 49 del Atlético de Madrid.
Pero durante su primera temporada, siendo alevín, solo jugaba las segundas partes de los partidos, ya que aún no entrenaba en las instalaciones de Lezama. Además de los 19 miembros actuales de la primera plantilla, también están Moyá, Carrasco, Gaitán y Sergi, que participaron en alguno de los nueve partidos de Europa League. Comenzó la campaña logrando dos tantos en la fase previa de la Liga Europa ante Young Boys y Tromsø. En la temporada 2008/2009 cumplió los 100 partidos en La Liga frente al Getafe Club de Fútbol el 28 de septiembre. Entre el 17 y el 20 de septiembre anotó sendos dobletes ante Austria de Viena y Villarreal. El 2 de diciembre vivió su primer gran partido como rojiblanco gracias al doblete anotado ante el Valencia, que permitió lograr una victoria en Mestalla después de veinte años. Min. 40.- Amarilla para Susaeta por una entrada dura a Mascherano. Goles: 0-1, min. 53: Koke.